基礎知識
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DICOM
MRI、CTなどで撮影された医用画像のフォーマットとそれらを扱うための医用機器間の通信プロトコルの事。
医療現場においては、超音波などの動的なデータ、音声などのデータも内包することもでき、電子カルテなどを通し参照している。
今回は、MRI、CTなどの一定間隔おきにスライスされた画像を用いて、３Dのモデルを作成する。
詳しい知識についてはWikipediaにて参照ください。
CTなどの医用画像データから臓器のモデリングする
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Summary
CT、MRIによって撮影された医用画像のデータから、臓器の3Dモデルを作成する方法です。
DICOMという医用画像のフォーマットからstlまでの変換の解説です。
DICOMという医用画像のフォーマットからstlまでの変換の解説です。
Materials
Tools
Blueprints
Making
- ・Mac OS使用ソフトウエアがMacのみのため・OsiriXオープンソースのDICOMビューワー無料版だと読み込み可能な枚数制限などあるが、本件については、無料版で解説とする。・DICOMデータ下記に記すいずれかの方法で入手してください。・3Dビューワー出来上がったstlファイルを見るのに使用します。今回はMeshMixierを使用します。
- 1.OsiriXダウンロードhttp://www.osirix-viewer.com/download_form/download_form.php上記URLにて、利用規約を確認、必須内容を入力し、ダウンロードリンクを入手2.インストーラーをすすめ、インストール3.Launchpadにアイコンが表示されればOK
- 下記のいずれかの方法で入手可能です。①病院でもらう病院などで検査をして、「CD-Rに入れてください」といえばデータがもらえるはずです。各病院によって値段は違うので、確認してみてください。②OsiriXのフリーのデータを使用する研究や教育目的での使用を許可されているFreeのDICOMデータをダウンロードし、使用。欲しいデータをクリックするとダウンロードが始まります。zipファイルがダウンロードされると思うので解凍してください。
- 今回は、臓器を3Dプリントできるようにすることが目的なので、骨から臓器をみれるようにしていきます。1.サーフェスレンダリング画面のアイコンのサーフェス設定を選択2.第一サーフェスの初期設定値を「CT - 皮膚」を選択3.骨部分ではなく、皮膚部分がレンダリングされるはず。※使用したデータはややぽっちゃりお腹でした。
- 右上歯車アイコン、「3D-SR 書き出し」をクリックし、形式を選択。「STLに書き出し」を選択し、名前をつけて保存してください。
- おなか全体が表示されているので、stlの調整にはMeshMixierを使用しました。編集の「面でカット」でざっくりカットし、必要な臓器部分を切り出します。
- 各々のツールで3Dプリントしてできあがりですー！複雑な形をしてるので、サポートつけると結構はずすのが大変でした。
References
Usages
Project comments
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