右ドラッグ：モデルの回転

CT画像の断面上でホイール回転：CT画像の断面の移動

何もない空間上でホイール回転

orホイールでドラッグ：ビューの拡大縮小

（拡張子は.dcm）

メニューバーから[File >Open DCM slices(.dcm)]を選択し、

全てのDICOMデータを全選択して開きます。

※データ量にもよりますが、読み込みには時間がかかります。

画像読み込み直後、対象物（昆虫）は可視化できていません（画像参照）。

対象物を可視化するためには、対象物のみを不透明にする必要があります。

このため、[Volume Information]というダイアログにある[transFunc1, transFunc2]のグラフを変更します。

※ダイアログ上部のチェックボックスから背景色やxyz平面の表示非表示などの変更ができます。

※伝達関数（transfer function）とは、画素値から透明度や画素値から擬似色へ変換する関数の総称です。

transfunc2は、横軸が画像勾配、縦軸が不透明度を表します。

グラフをマウスでなぞるようにすると、グラフの形を変更できます。

対象物の周りの空間は輝度値が低く、対象物自体は輝度値が高いため、参考画像のグラフのように輝度値が低い部分の不透明度を０にすることで、周りの空間が表示されなくなり対象物が浮かび上がります。

ただし、右図の場合、対象物の乗っている地面も輝度値が高く、厳密には対象物「だけ」を浮かび上がらせることはできません。

[Volume Information]ダイアログ上部の、[XY][YZ][ZX]のチェックマークを入れると、それぞれの平面が表示され、断面図を見ることができます。

断面図上のなるべく明るいところを、ダブルクリックし赤い点を付けます。

この値に関しては、様々な値を試して見る他ありません。

※目安（撮影するCT装置にも依存）

昆虫　： 最小値3000~9000、最大値そのまま

貝/種子: 最小値15000~20000、最大値そのまま

※Region growing法は、シード（赤点）から始め、閾値を満足する画素を追加する要用で領域を拡張していく手法です

CT画像上で選択されている範囲が赤く表示されます。

この赤い表示はスペースボタンを押すことで非表示にできるので、元のCT画像の選択した部分（白いところ）と、赤い選択範囲がぴったりあっているか、調整しながらRegion Growingを行うと良いです。

先ほど分割したregionが選択されていることを確認して、[OK]を押します。

※backGrndは選択できません。

Shitボタンを押しながら、

トリミングを行いたい部分を左クリックでドラッグして選択します。

※ドラッグで選択している部分をキャンセルしたい場合は、右クリック。

※Zキーを押すとやり直す(Undoする)ことができますが、一回しか戻ることができません。

[Finish Editing]を押して、トリミングの完了です。

[Mask IDs]ダイアログで[2:region]を選択し、[Delete]ボタンを押せば削除できます。

[Marge To]ボタンを押し、統合させたい領域を選択すれば、２つの領域を統合させることも可能です。

先ほど領域分割をしてトリミングを行ったregionを選択してから行いましょう。

[transparency]（不透明度）を下げると、選択領域の不透明度が下がり断面が見えるので、作業が行いやすいです。

1. [dilate]ボタンを押して領域を１画素分を太らせる

2. [fill hole]ボタンを押して外とつながっていない中空領域を埋める

3. [erode]ボタンを押して全体を痩せさせる（厚みを元に戻す）

この手順を踏み、小さな穴を埋めていきます。

場合に応じて、[dilate][erode]ボタンを複数回押しましょう。

※dilate -> erodeの処理は、closingと呼ばれ、小さな中空領域が自動的に埋まる効果があります。