電源分離後に動作テストをしたところ、なぜかRightのモータしかmoveされていませんでした。
mbedのhttpサーバーに対して、コントローラからright、leftと続けてGETをしていますが、mbedでleftのGETを取りこぼしているようです。このためコントローラーの動きと連動しなかったのでしょう。
rightとleftで別々のAPIをコールしていましたが、左右のモータは１つのAPIとし、左、右のスピードを同時に渡すようにしました。
新しいモーターAPIの使用例は以下の通り。
/api/motor/speed?left=243&right=245&time=1431252304779

これでコントローラーの情報が正確に左右に伝わるようになりました。